An interpretable machine learning approach to determining the mechanism of action of antibiotics

  • World Well being Group et al. A scarcity of recent antibiotics threatens international efforts to include drug-resistant infections. (2020).

  • Neil J. or Antimicrobial Resistance: Addressing the Disaster of Well being and Wealth of Nations, Chaired Evaluate of Antimicrobial Resistance. in Evaluate of the paper addressing the well being and wealth of countries disaster1-20 (HM Authorities Wellcome Belief, 2014).

  • Pence, HE, and Williams A. Kimspider: An On-line Chemical Info Supply (2010).

  • Kim, S.; et al. Pubchem article and composite databases. eat. Res acids. 44(D1), D1202, D1213 (2016).

    CAS
    Article – Commodity

    Google Scholar

  • Irwin, JJ & Shoichet, BK Zinc – Free database of commercially out there autos for digital inspection. J. Kim. pedestrians. Mannequin. 45(1), 177-182 (2005).

    CAS
    Article – Commodity

    Google Scholar

  • Ashby, c. The worth and limitations of short-term genotoxicity assays and the inadequacy of the present bio-cancer biotest chemical choice standards. that. New York Acad. Sciences. 534(1), 133-138 (1988).

    commercials
    CAS
    Article – Commodity

    Google Scholar

  • King, R. D., Muggleton, S., Lewis, R. A. & Sternberg, M. Drug design by machine studying: utilizing inductive logic programming to mannequin the structural and exercise relationships of trimethoprim analogues linked to dihydrofolate reductase. Brooke. natel. cad. Sciences. 89(23), 11322-11326 (1992).

    commercials
    CAS
    Article – Commodity

    Google Scholar

  • Hirst, J. D., King, RD & Sternberg, M. J. Construction relationships and quantitative exercise by neural networks and inductive logic programming. 1. Inhibition of dihydrofolate reductase by pyrimidine. J. Pc Aided Mall. dis. 8(4), 405-420 (1994).

    commercials
    CAS
    Article – Commodity

    Google Scholar

  • Bronstein, M. M., Bruna, J., LeCun, Y., Szlam, A. & Vandergheynst, P. Geometric deep studying: Going past Euclidean information. IEEE sign course of. magazine. 34[4)،18-42(2017)

    إعلانات
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • ستوكس ، جم وآخرون. نهج التعلم العميق لاكتشاف المضادات الحيوية. خلية 180[4)،688-702(2020)

    CAS
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • تضمين Dai، H.، Dai، B.، & Song، L. نماذج متغيرة كامنة للبيانات المنظمة. في المؤتمر الدولي للتعلم الآلي، 2702-2711 (PMLR ، 2016).

  • يانغ ، ك. وآخرون. تحليل التمثيلات الجزيئية المكتسبة للتنبؤ بالممتلكات. J. كيم. المشاة. نموذج. 59(8) ، 3370-3388 (2019).

    CAS
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • طاولة مكتب وآخرون. علاقة التصميم والتركيب والهيكل – النشاط للركيزة التنافسية والانتقائية ومثبطات التريازول والثياديازول النشطة في الجسم الحي لمثبطات c-jun n-kinase. جيه ميد. علم. 52[7)،1943-1952(2009)

    CAS
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • Chen، X.-W.، & Jeong، JC Enhanced recursive feature حذف. في المؤتمر الدولي السادس حول التعلم الآلي والتطبيقات (ICMLA 2007)، 429–435 (IEEE، 2007).

  • اختيار ميزة Kursa، MB & Rudnicki مع حزمة Boruta. J. ستات. سوفتو. 36، 1-13 (2010).

    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • Tibshirani، R. الانحدار الانحدار والاختيار عبر lasso. جيه آر ستات. شركة سر. ميثودول ب. 58(1) ، 267-288 (1996).

    MathSciNet
    رياضيات

    منحة جوجل

  • Pope، PE، Kolouri، S.، Rostami، M.، Martin، CE، & Hoffmann، H. طرق التفسير للرسم البياني للشبكات العصبية التلافيفية. في وقائع مؤتمر IEEE / CVF حول رؤية الكمبيوتر والتعرف على الأنماط، 10772-10781 (2019).

  • كوجيما ، ر. وآخرون. kgcn: إطار عمل تعليمي عميق قائم على الرسم البياني للهياكل الكيميائية. J. Cheminform. 12(1) ، 1-10 (2020).

    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • Baldassarre، F.، & Azizpour، H. تقنيات التفسير لشبكات الرسم التلافيفي. CoRR، المجلد. ABS / 1905.13686 ، (2019).

  • مونتافون ، ج. ، لابوشكين ، إس ، بيندر ، إيه ، ساميك ، دبليو ومولر ، K.-R. شرح قرارات التصنيف غير الخطية مع تحلل تايلور العميق. التعرف على الأنماط. 65، 211 – 222 (2017).

    إعلانات
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • Ying، R.، Bourgeois، D.، You، J.، Zitnik، M.، & Leskovec، J. Gnn الشرح: أداة لشرح ما بعد المخصص للشبكات العصبية للرسم البياني. طبع arXiv المسبق arXiv: 1903.03894، (2019).

  • كورسيلو ، SM وآخرون. مركز إعادة توظيف الأدوية: مكتبة أدوية من الجيل التالي ومصدر معلومات. نات. ميد. 23[4)،405-408(2017)

    CAS
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • Zuegg، J.، Hansford، KA، Elliott، AG، Cooper، MA & Blaskovich، MA كيفية تحفيز وتسهيل اكتشاف المضادات الحيوية في المرحلة المبكرة. تصيب ACS. ديس. 6(6) ، 1302-1304 (2020).

    CAS
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • Blaskovich، MA، Zuegg، J.، Elliott، AG ​​& Cooper، MA مساعدة الكيميائيين على اكتشاف مضادات حيوية جديدة. تصيب ACS. ديس. 1[7)،285-287(2015)

    CAS
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • Reeve، SM، Lombardo، MN & Anderson، AC إن فهم الآليات الهيكلية لمقاومة المضادات الحيوية يضع منصة لاكتشاف جديد. ميكروبيول المستقبل. 10(11) ، 1727-1733 (2015).

    CAS
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • تحفز المضادات الحيوية Cho ، H. ، Uehara ، T. & Bernhardt ، TG Beta-lactam خللاً مميتًا في آلية تصنيع جدار الخلية البكتيرية. خلية 159(6) ، 1300-1311 (2014).

    CAS
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • المضادات الحيوية Pham و TD و Ziora و ZM & Blaskovich و MA Quinolone. MedChemComm 10(10) ، 1719-1739 (2019).

    CAS
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • بيرسون ، ج. وآخرون. مسارات كيناز البروتين المنشط بالميتوجين (MAP): التنظيم والوظائف الفسيولوجية. إندوكر. القس. 22(2) ، 153-183 (2001).

    CAS
    PubMed

    منحة جوجل

  • فليمان ، ر. وآخرون. المكتبات التوافقية كأداة لاكتشاف عوامل جديدة مضادة للجراثيم واسعة الطيف تستهدف مسببات الأمراض ESKAPE. جيه ميد. علم. 58(8) ، 3340-3355 (2015).

    CAS
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • وانج ، ب. وآخرون. ثنائي أمين مضاد للبكتيريا يستهدف الأغشية البكتيرية. جيه ميد. علم. 59[7)،3140-3151(2016)

    CAS
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • Qian ، L. ، Guan ، Y. ، He ، B. & Xiao ، H. بوليمرات الغوانيدين المعدلة: آلية التركيب ومضادات الميكروبات التي كشف عنها AFM. بوليمر 49(10) ، 2471-2475 (2008).

    CAS
    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • Olender ، D. ، Żwawiak ، J. & Zaprutko ، L. الفعالية متعددة الاتجاهات لمركبات النيترو النشطة بيولوجيًا المدرجة في الأدوية. الأدوية 11(2) ، 54 (2018).

    مقالة – سلعة

    منحة جوجل

  • ويت ، ج. وآخرون. تخليق مشتقات الهيدرازون من 4-[4-formyl-3-(2-oxochromen-3-yl) pyrazol-1-yl] Benzoic acid as potent progress inhibitors of antibiotic resistance Staphylococcus aureus And the stagnant bomanian. Molecules 24(11), 2051 (2019).

    Article – Commodity

    Google Scholar

  • Lv, Q.-Z. et al. A novel antifungal agent (4-phenyl-1, 3-thiazole-2-yl)hydrazine causes oxidative injury in Candida albicans. In entrance of me. cell. infect. microbiol; 10557 (2020).

    Article – Commodity

    Google Scholar

  • Landrum, c. et al.. rdkit: an open supply chemin informatics. (2006).

  • Weininger, D. Smiles, Chemical language and data system. 1. Introduction to methodology and coding guidelines. J. Kim. pedestrians. laptop. Sciences. 28(1), 31–36 (1988).

    CAS
    Article – Commodity

    Google Scholar

  • He, E, Ma, Y. Unbalanced studying: foundations, algorithms, and purposes (Wiley, 2013).

    the e-book

    Google Scholar